En un proyecto legislativo bajo la firma de Jorge Selser, Julian D'angelo, Maria Elena Naddeo, Gabriela Cerruti y Rafael Gentili proponen que "Frente a la publicación aparecida en un matutino en el día de hoy, donde se observa un recibo de sueldo de la Mutual del Banco Provincia a nombre del Ministro Lemus, que deja claro que el Ministro se desempeña como asesor médico de dicha mutual, esta Legislatura considera que existe una incompatibilidad institucional, ética , moral, y además una franca contradicción con el Artículo 73 y el Articulo 101 de la Constitución de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires, que establece la incompatibilidad en el desempeño de cualquier otra función rectora, de asesoramiento o mandato de empresa que contrate con la Ciudad o sus entes autárquicos o descentralizados". 

Los diputados de los Bloques: Partido Socialista - Del Sur - Union Cívica Radical - Coalicion Civica - Dialogo Por Buenos Aires - Nueva Izquierda - Eva Peron - Peronista - Encuentro Popular Para La Victoria - Proyecto Sur - Nuevo Encuentro - Mst Nueva Izquierda sostiene que "Como exponente de las falencias en su gestión y en relación al estado edilicio de los hospitales que integran el Sistema de Salud del GCBA, podemos citar el caso de la inconclusa Unidad de Terapia Intensiva Pediátrica del Hospital de Quemados; la paralización de las obras del Hospital Infanto Juvenil “Carolina Tobar García”; la falta de información adecuada sobre el Proyecto Arquitectónico que incluirá a los hospitales Udaondo, Ferrer y Muñiz; la grave situación del Hospital de Gastroenterología “Dr. Bonorino Udaondo y del Rivadavia, el incumplimiento de los términos de finalización de las obras del Hospital Durand y la falta de resolución del mantenimiento y remodelación de pabellones en el Hospital Braulio Moyano" y agregan "También se incumplió con la compra de equipamiento hospitalario, cuya licitación fuera mencionada en la visita del ministro a esta Legislatura el 6 de abril, de la que no se envió la información prometida entonces.
Respecto de la licitación 1643/09 de lavaderos, el informe de la Comisión de Evaluación Técnica del Ministerio rubricó que el LAVADERO EL LUCERO S.R.L. daba cumplimiento con la totalidad de las exigencias previstas en los Pliegos de Bases y Condiciones y Anexos Técnicos y luego fue clausurado por el GCBA por presentar graves falencias
También fueron denunciadas en esta Legislatura la provisión y distribución de medicamentos a cargo de la empresa PROGEN y se realizaron pedidos de informe sobre el vencimiento de medicamentos en depósitos por fallas en la logística".

Mas datos se agregan al cuestionamiento al ministro Lemus "a falta de medidas para atender las emergencias médicas en la villa 21-24 perteneciente al área programática del Hospital General de Agudos “José M. Penna”
La acumulación de cargos del Ministro Jorge Lemus, en una gestión caracterizada por la falta de atención a la grave situación que atraviesa el Sistema de Salud, con aumento de la tasa de mortalidad infantil, de la incidencia de TBC y sífilis congénita y las falencias que llevaron a la judicialización de su gestión de gobierno, evidencia claramente que el Ministro Dr. Jorge Daniel Lemus ha incumplido con los deberes de funcionario público".

Por otro lado, la legisladora del bloque Diálogo por Buenos Aires, María Elena Naddeo solicitó al ministerio de salud un pedido de informes sobre la mortalidad infantil en la Ciudad:

a. Indicar los motivos que llevaron a un incremento de un punto en la mortalidad infantil durante 2009 en nuestra Ciudad, luego de dos décadas de descenso sostenido de dicha cifra.
b. Aportar un informe detallado de las causas tanto de la mortalidad neonatal como de la mortalidad post neonatal, durante este período.
c. Analizar las razones por las cuales las diferencias en las cifras de mortalidad infantil alcanzan tal proporción entre los barrios del sur y del norte de la Ciudad – que llegan a los extremos de 12, 8 casos por mil en Villa Lugano, Villa Riachuelo y Villa Soldati y 4, 9 por mil en Belgrano, Colegiales, Nuñez.
d. Señalar qué medidas se han adoptado en relación a estos hechos, particularmente:
• campañas de promoción de la salud materno-infantil y concientización acerca de los cuidados prenatales.
• incremento de los centros de atención materno- infantil en la zona sur.
• incremento del número de profesionales médicos – ginecólogos/as, obstetras, pediatras, anestesistas-, trabajadores sociales, enfermeros/as y otros destinados a esta temática. 
• si se ha establecido alguna articulación con los programas del Ministerio de Desarrollo Social para los casos en que se requieran recursos para un nivel de vida adecuado.
• otras acciones que puedan complementar las medidas para la disminución de la mortalidad infantil.

En su fundamentación da cuenta de que "Las tasas de mortalidad infantil son posiblemente uno de los indicadores más reveladores de las condiciones de vida y de la pertinencia de las políticas públicas en materia de salud y desarrollo social que brinda el estado.
Es de público conocimiento que la Ciudad de Buenos Aires tiene condiciones privilegiadas para atender a su población, por lo que siempre ha tenido, junto a Tierra del Fuego, las tasas más bajas del país.
Por otra parte, desde 1990 la mortalidad infantil tuvo una disminución permanente en la Ciudad, logrando que bajara desde el 16 por mil a 7,3 en 2008, y esto pese a los períodos de intensa crisis económica que se atravesaron. Por lo tanto, este incremento de un punto en 2010 es una sensible alarma que indica fallas importantes en la atención de las madres y los recién nacidos.
La explicación del Ministro de Salud, Dr. Jorge Lemus, reproducida en algunos medios de comunicación, afirmando que “el aumento de 2009 se debe a causas no reducibles , que según la Organización Mundial de la Salud son aquellas por las que el sistema de salud o la ciencia no pueden hacer nada” resulta muy poco convincente, dadas las escandalosas diferencias que se registran entre la mortalidad infantil en las zonas norte y sur de la Ciudad.
Si en los barrios con niveles de vida más altos se logran tasas de menos del 5 por mil, suponer que nada puede hacerse para bajar indicadores del 12,8 por mil es dar por sentado que las diferencias producidas por el acceso a bienes y servicios, salud, educación, alimentación y vivienda adecuadas, son del orden de lo “natural” y que las políticas públicas son impotentes para establecer mayores grados de igualdad y justicia.
No podemos dejar de señalar, por otra parte, que no empeñar todas las acciones pertinentes en búsqueda de estos objetivos es contravenir en todas sus partes el texto y el espíritu de la Constitución de la Ciudad".